真菌性鼻竇炎的手術後遺症包括以下幾點：

1、鼻腔局部的後遺症，常見的有術後鼻子乾燥、鼻子燒灼感、反覆流鼻涕、嗅覺下降等相關的表現，有的患者還有出血的風險，如果術中有篩前動脈損傷、蝶顎動脈損傷可能有術後出血的風險，有的患者在開蝶竇的過程中有頸內動脈的損傷，會出現致命性大出血，有的患者還可以出現鼻腔粘連、空鼻綜合徵等相關改變，還有萎縮性鼻炎等相關症狀，還有術後復發的可能。

2、顱內的併發症，患者可以出現腦脊液鼻漏、顱內血腫、顱內腦膜炎、海綿竇血栓性靜脈炎等相關的疾病。

3、眶的併發症，如果術中損傷眶內壁或者眼外肌可導致患者出現眼球活動受限，損傷視神經可以導致患者出現失明、複視等相關的情況。

總體來說鼻竇炎尤其真菌性鼻竇炎，術後的後遺症還是比較少的，但上述的併發症在理論上有發生的可能。