大多數慢性萎縮性胃炎患者無自覺症狀，多在體檢時偶然發現而就診；有症狀者也缺乏特異性，主要表現為胃脹、胃疼、消化不良、噁心、打嗝等。目前臨床上主要通過胃鏡和組織病理檢查明確診斷。由於我國的胃鏡檢查與組織病理檢查尚存在一定的差異性，單靠胃鏡檢查不能篩查出所有患者，所以組織病理學檢查為診斷慢性萎縮性胃炎的金標準。