導致艾滋病的病毒為人類免疫缺陷病毒(HIV)，通過檢測HIV核酸，有助於檢測出艾滋病。通常患者感染HIV後2周，在血液中能檢測到HIV核酸，但該檢測是診斷艾滋病的輔助手段，而診斷艾滋病的金標準是檢測血液中HIV抗體。HIV核酸檢測可以用於判斷艾滋病患者的病情，以及根據核酸水平制定抗病毒方案，還可在治療過程中對療效進行判斷。

對於年齡18個月內的兒童，可以通過2次核酸檢測來診斷艾滋病。對於金標準，艾滋病抗體篩查及確認試驗結果均為抗體陽性，即可診斷為艾滋病。如果在檢測抗體的過程中是陰性，但高度懷疑艾滋病感染，有艾滋病病毒暴露史，同樣可以通過核酸的檢測方法來判斷是否感染艾滋病。