確診消化性潰瘍的檢查手段首選是胃鏡，也可以是膠囊內鏡。因為胃鏡檢查能夠直觀觀察潰瘍位置、大小、形態，以及胃底部周圍黏膜充血、水腫等情況。另外可以在此基礎上進行活檢、止血，有時潰瘍甚至可以進行組織夾閉，促進潰瘍癒合。因此沒有哪種檢查能夠代替胃鏡操作。

無法進行胃鏡檢查的病人可以進行上腹部CT、鋇餐、普通造影，但是隻是間接徵象，不能代替膠囊內鏡，因為不能取活檢，所以也不能代替胃鏡檢查。