甲溝炎患者口服頭孢或阿莫西林均可起到一定治療效果，一般可在局部塗抹消炎類藥膏，口服或全身應用抗生素大多以頭孢或青黴素類藥品為主。局部炎症口服抗生素不如重點處理感染部位，甲溝炎診斷和治療過程中，組織保護和處理較為重要。

甲溝炎發生大多由日常生活中指甲修剪過深，或去除肉刺時形成軟組織損傷引起。為預防甲溝炎，應儘可能保護指甲周圍軟組織完整性，以及保持局部清潔乾燥，細菌無法通過損傷入侵，便無法形成甲溝炎。形成損傷和局部細菌繁殖後，可通過應用局部或全身抗生素控制感染。控制炎症配合使用抗生素，多數甲溝炎均可自行緩慢癒合。