腳部甲溝炎想要治療、除根，關鍵要尋找引起甲溝炎的根本病因。甲溝炎屬於指甲兩側甲溝部位細菌感染或者真菌感染引起的炎症，要對症進行抗菌、消炎治療。如果沒有去除病因，此病有可能再次復發。有一些甲溝炎只是由於局部外傷引起，包括指甲局部過度修剪，導致皮膚損傷，細菌乘虛而入引起局部發生甲溝炎等。

只要足療程使用抗菌、消炎藥物，將局部炎症徹底控制後，以後修剪指甲時，避免外力對甲板、甲溝刺激，通常可以除根。但部分患者可能由指甲生長畸形引起嵌甲，指甲向甲溝皮膚深處生長，引起頑固性甲溝炎，炎症控制後，還可以再次復發，需要做嵌甲矯正手術。嵌甲徹底根治後，甲溝炎才有可能不再復發。