甲溝炎手術需要行局麻或神經阻滯麻醉，因此手術過程中只有輕微疼痛或者沒有疼痛。如果甲溝炎患者有明顯的甲溝旁膿腫，膿腫產生明顯的紅腫、疼痛以及發熱症狀，有發生化膿性骨髓炎的風險，需要在局麻或神經阻滯麻醉下行拔甲術、膿腫切開排膿術、引流術。

甲溝炎手術後需定期換藥，使用雙氧水、碘伏、生理鹽水反覆沖洗和浸泡傷口，使壞死物質排出，殺滅細菌。換藥後可外敷百多邦軟膏或鹽酸金黴素眼膏，進一步起到保護創面以及消炎殺菌作用，術後患者需用敷料包紮傷口，避免傷口受灰塵或汙水的二次汙染。如果有需要，患者需在術後口服消炎藥物，常用的是頭孢類抗生素和阿莫西林等。