肛門瘙癢一般可以就診於兩個科室，即皮膚科與肛腸科，但需根據具體情況具體分析。如果有肛門周圍常見病，如痔瘡、肛裂、肛瘻、肛周膿腫、直腸脫垂、直腸息肉、炎症性腸病等導致肛門周圍瘙癢，需到肛腸科就診，找專業的醫生進行正規的指導治療。

若經過肛腸科檢查，如果沒有肛腸科常見疾病或腸道炎症性疾病，只是單純的肛門周圍瘙癢，如皮膚過敏或接觸異物導致肛門周圍瘙癢，可以到皮膚科找專業醫生進行指導治療，效果較好。