引起排卵障礙的因素較多，且該病可能合併全身性疾病，病程較長，治療難度大，故臨床上大多排卵障礙無法完全治癒。只能根據患者具體情況，改善其病症，或預防併發症的發生。臨床上根據女性不同年齡，不同生理階段，進行個性化治療。如多囊卵巢綜合徵引起的排卵障礙，有生育意願時，主要進行促排卵治療，育齡期婦女無妊娠要求或年齡偏大者，主要以預防併發症發生或保健為主。