牙疼多數是由於需氧菌或者厭氧菌感染引起的炎症所致，如智齒冠周炎、牙髓炎、根尖周炎、牙周炎等疾病，都會造成不同程度的牙疼。服用甲硝唑和牛黃甲硝唑均能治療牙疼，相比之下，甲硝唑藥物作用較強，可以緩解大多數厭氧菌感染引起的牙周炎，但具體要根據病因、藥效等，合理選擇用藥。

甲硝唑與牛黃甲硝唑最大的區別是成分上的不同，牛黃甲硝唑屬於複方藥，成分中包括人工牛黃和甲硝唑兩種。人工牛黃最主要的作用是解熱止痛，與甲硝唑藥物相比，含有的甲硝唑成分較少，因此牛黃甲硝唑的消炎作用，相對於甲硝唑較小。故如是根尖炎、牙周炎等炎症較重的疾病所引起的牙疼，需要及時進行消炎處理時，建議應用甲硝唑治療；但如果患者炎症反應較小，只是輕度的疼痛，則可以用牛黃甲硝唑解熱止痛。

但仍有部分牙疼無法通過上述兩種藥物緩解，需要針對具體情況進行相應處理。如牙髓炎，由於牙髓組織發炎導致牙體硬組織壓迫出現疼痛，上述藥物無法達到解除壓迫的作用，因此出現牙髓炎時服用上述藥物，並不奏效；三叉神經痛引起的牙疼也不可能通過上述藥物緩解，這是因為兩者並不會作用於三叉神經。另外，還有一些炎症是由需氧菌或者厭氧菌合併感染引起的，治療時除服用甲硝唑、牛磺甲硝唑外，還應服用頭孢、阿莫西林或者紅黴素等聯合治療。

此外，牙疼除了服用藥物來緩解症狀外，還應該積極尋找病因，進行對因治療，如牙髓炎、根尖周炎導致的牙疼還應及時進行根管治療，以達到徹底控制感染，避免疼痛反覆發作的目的。