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輔助生殖技術的雙胎率可能比自然懷孕要高點，但是雙胎危害更大，所以不建議患者以生雙胞胎為目的做試管嬰兒。由於促排卵藥物的使用和輔助生殖技術的出現，多胎妊娠率明顯增加。促排卵藥物可以促 進多個卵泡同時發育和排卵，從而導致多胎妊娠的發生。輔助生殖技術中，多胎妊娠的發生與向宮腔移植多個胚胎有關。減少多胎妊娠的對策具體如下：1、嚴格掌握促排卵藥物應用指徵，同一個週期控制1-2個主導卵泡發育排卵，從而減少多胎妊娠的發生；2、通過減少移植胚胎數目而減少多胎妊娠的發生。衛生部在人類輔助生殖技術規範中明確規定，每個週期移植的胚胎不超過3個。2017年中華醫學會生殖醫學分會，在輔助生殖技術行業規範指南和專家共識中推薦，對於預後良好的35-37歲的患者，建議選擇單胚胎移植。2018年12月，海南省人類輔助生殖技術指控中心建議，胚胎移植一般不超過2個。對於年齡＜35歲，首次移植的患者和有單胚胎移植指徵的患者，推薦使用單胚胎移植。
雙胎妊娠的絨毛膜性判斷對於雙胎監測及預後評估非常重要。一卵雙胎由兩個獨立的受精卵發育而來，植入子宮併發育出它們各自的胎盤及雙絨毛膜雙胎。同卵雙胎由一個受精卵發育而來，分裂發生的時間決定著絨毛膜性及胎盤數量，如分裂 發生在受精後的3天內，則雙胎各自將擁有自己的胎盤，也叫雙絨毛膜雙胎。同卵雙胎分裂發生於受精3天之後，這樣的雙胎會共享一個胎盤稱為單絨毛膜雙胎。單絨毛膜雙胎可能會發生一系列併發症，如雙胎輸血綜合徵、雙胎動脈反向灌注序列徵及雙胎選擇性生長受限等。由於單絨毛膜雙胎的胎盤存在血管交通吻合支特點，如果其中之一發生胎死宮內，對存活胎兒存在發生腦損傷的風險。單絨毛膜雙胎妊娠胎死宮內的風險是雙絨毛膜雙胎的3.6倍，在妊娠24周前發生流產的風險是後者的9倍。對於單絨毛膜雙胎建議妊娠16周起，至少每2周進行一次超聲檢查，並建議在當地有經驗的產前診斷中心檢查，評估胎兒及母體風險。
孕婦多胎妊娠減胎術後，需要以抗感染以及安胎為主要工作。孕婦一定要按時監測各項指標。孕婦需聽從醫囑、定期複查B超檢查，如出現下腹痛、陰道出血，及時就診，與醫生溝通治療。孕婦出現感染、陰道流血、下腹痛等先兆流產表現應暫緩減胎。孕婦有先兆流產情況常規採用安胎治療，情況穩定之後，再選擇合適減胎時機進行減胎手術。多胎妊娠減胎手術有風險，儘量保證孕婦有一個存活健康胎兒。
多胎妊娠存在的併發症包括以下幾種：1、流產：胎兒個數越多，流產風險性越大，與胚胎畸形、胎兒發育異常、胎盤血液循環障礙及宮腔容積相對狹窄有關；2、胎兒畸形：雙胎妊娠胎兒畸形率比單胎高2倍，單卵雙胎畸形兒數又是雙卵雙胎的2倍。畸形率增高的原因尚不清楚，宮內壓迫可致先 天性髖關節脫位等胎兒局部畸形；3、貧血：由於腹中的多胞胎血容量增加多，孕婦對鐵的需要量增加，而日常的攝入基本難以滿足多胞胎的生長發育；4、妊娠期高血壓疾病：多胎妊娠發生該病的幾率是單胎妊娠的3倍，症狀出現早且重者居多，往往不容易控制，子癇發生率也高；5、前置胎盤：由於胎盤面積大，易擴張至子宮下段而覆蓋子宮的宮頸內口，發生率比單胎高1倍；6、早產：由於子宮的過度生長，尤其胎兒的個數多，併發羊水多、宮腔壓力過高，早產的發生率高；7、雙胎輸血綜合徵：主要是單絨膜單卵雙胎妊娠的嚴重併發症，由於兩個胎兒的血液循環經胎盤吻合血管溝通發生血液輸，從而血流不均衡引起；8、雙胎之一宮內死亡；9、其他：分娩期易出現產程延長、胎位異常、胎膜早破、臍帶脫垂、胎盤早剝、產後出血及產褥感染等。
減胎術對存活胎兒有一定影響，增加了存活兒先兆流產、流產，甚至死胎的風險，但是多胎妊娠選擇減胎術是兩害相權取其輕的做法，目的是為了讓存活兒能夠更好的生存下去，提升其生存質量和提升存活率。行使減胎術時也會用藥物保胎，保證存 活兒在宮內的安全。
單絨毛膜性雙胎根據是否位於同一個羊膜囊內，可以分為單絨毛膜雙羊膜囊雙胎和單絨毛膜單羊膜囊雙胎。單絨毛膜雙羊膜囊雙胎建議至妊娠16周開始，至少每2周進行一次超聲檢查，評估雙胎的生長發育，羊水分佈和胎兒臍動脈血流等，並酌情檢查胎兒 大腦中動脈血流和靜脈導管血流。因為單絨毛膜雙羊膜囊雙胎可能會發生一系列的併發症，如雙胎輸血綜合徵、雙胎動脈反向灌注序列徵及雙胎選擇性生長受限等。單絨毛膜單羊膜囊雙胎在妊娠早、中期即可能存在雙胎間的臍帶纏繞，導致胎兒死亡率極高，產前檢查需要充分告知孕婦存在發生不可預測的胎兒死亡風險，建議定期進行超聲檢查，評估胎兒的生長發育和多普勒血流。對雙絨毛膜單羊膜囊雙胎剖宮產作為推薦的分娩方式，妊娠32-34周應酌情終止妊娠，以儘可能降低繼續妊娠過程中胎兒所面臨的風險。
有文獻報道減胎術後流產率為6%-22%不等，一般認為與採取的手術方法、時間等有關。減胎術後的流產，部分患者並不是在手術後馬上發生，而是發生在手術後較晚的時間，有的甚至間隔1-2個月。術後較晚的流產機制還沒有明確，可能的原因是胚胎本身發育異常，到了一定妊 娠時間發生胚胎停育，與手術無關。有報道稱有3/4的染色體非整倍體引起的流產發生在懷孕8周前，而染色體整倍體的流產高峰是在懷孕13周。其次，推測可能是機械破壞引起的非特異性炎症或者穿刺繼發的感染導致流產發生。有研究表明實施減胎術後的妊娠結果與術後分娩的胎數有關，即減胎後留下單胎的妊娠結果比雙胎好。減胎數並不增加妊娠期產科併發症的發生率，熟練的多胎妊娠減胎術是一種比較安全且創傷較小的，可以有效改善多胎妊娠結果的方法。
雙胎妊娠的孕婦屬於無創DNA產前篩查的慎用人群，目前無創DNA檢測主要適用於單胎。雙胎無創DNA檢測準確性與胎兒遊離DNA濃度密切相關，單絨雙胎因遺傳物質一致，在胎兒遊離DNA總量達到40%足以進行檢測，與單胎相同，但雙卵雙胎的染色體核型常不一致，如果異常胎兒的遊離DNA量低於臨界值4%，而正常胎兒的DNA量足夠多，在總遊離DNA量達到檢測所需的最低值時，檢測結果可能會因為正常胎兒掩蓋了異常胎兒而提示低風險，導致假陰性結果出現。因此醫生需告知孕婦，雙胎妊娠孕婦進行無創DNA檢測時，其檢出率會下降，假陽性率會上升，孕婦在知情同意的情況下可以選擇進行無創DNA檢測。雙胎妊娠孕婦如果出現產前診斷指徵，如高齡、超聲發現胎兒異常或生育過異常胎兒的病史，建議首選進行產前診斷，如羊膜腔穿刺術或臍靜脈穿刺術，直接進行胎兒染色體疾病的診斷。
多胎妊娠出生的嬰兒在生長發育和健康方面，較單胎的嬰兒存在的風險比較高，雙胎和三胎髮生嚴重發育障礙的風險較單胎高1.7倍和2.9倍。減胎術分為選擇性減胎術和多胎減胎術，選擇性減胎術是減滅了有畸形或基因缺陷的胎兒，多胎減胎術是作為出現多胎後改善妊娠 結局的補救措施。減胎過程中可能出現穿刺針損傷胎盤、血管形成胎盤早剝、宮內出血的問題，同時還有誤傷非靶向目標的可能，也就是不想減這個胎兒，但是實際上減掉了這個胎兒，同時導致被減掉的胎兒丟失孕卵，造成孕婦術後有一些出血、感染、腹痛、流產的表現。建議孕婦進行減胎以後要加強監護，必要時進行保胎治療。
在臨床上常見的多胎，一般與促排卵用藥有關。臨床上正常的自然雙胎率，如果針對漢族人而言，雙胎以上的發生概率不足1%。但是由於目前促排卵藥物的應用，以及助孕技術的增加，就會出現多胎。宮內同時懷有2個以上的孩子，臨床上稱之為多胎。多胎對人體有一定的害處，多胎會影響母體 ，增加母體出現妊娠期糖尿病、高血壓、心臟病的風險。多胎妊娠對胎兒也有一定的害處，容易導致胎兒在宮內發育較小。另一個最常見的害處，會導致胎兒早產，早產之後的孩子體重過輕，器官發育不完善，對新生兒的遠期生長發育不利。
雙胎妊娠出現胎兒結構異常的概率較單胎妊娠高1-2倍，在雙卵雙胎妊娠中，胎兒畸形的發生概率與單胎妊娠相似，而在單卵雙胎中胎兒畸形的發生率增加2-3倍。最常見的畸形為心臟異常、神經管缺陷、面部發育異常、胃腸道發育異常和腹壁裂等。建議在妊娠18-24周最晚不要超過26周，對雙胎 妊娠進行超聲結構篩查，雙胎妊娠容易因胎兒體位的關係影響結構篩查的質量，導致篩查較為困難。有條件的醫療機構可以根據孕周分次進行，包括胎兒心臟在內的結構篩查，如發現可疑異常，應及時轉診至區域性的產前診斷中心。雙胎妊娠通過三維超聲進行胎兒畸形的排查最佳時間段為孕22-26周。
判斷絨毛膜性對雙胎妊娠的評估及妊娠管理至關重要。單絨毛膜雙胎妊娠胎死宮內的風險是雙絨毛膜雙胎妊娠的3.6倍，在妊娠24周前發生流產的風險是後者的9倍，建議在當地有經驗的產前診斷中心進行跟蹤，評估胎兒和母體風險。