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小兒癲癇小發作必須到醫院就診，因為癲癇小發作通常表明患兒可能存在一些基礎疾病，需完善腦電圖、核磁共振等檢查，明確引起小發作的原因。另外，要積極治療，儘早使用卡馬西平、奧卡西平等對小發作控制較好的藥物。
多數小兒癲癇部分性發作控制較好，得益於目前類型較多的抗癲癇藥物，效果不好時可以更換種類，甚至多藥聯合使用。藥物控制不好的患兒可以進一步檢查，30%的藥物難治性癲癇即使藥物控制不好，也可以通過手術的方法進行治 療，比如病灶切除。
兒童癲癇病大部分可以治好。所有的癲癇患者中可能有50%以上是在兒童期發病，所以兒童癲癇患者較多，70%或以上的患兒通過藥物可以得到控制。儘管有些藥物服用時間可能要3年，甚至更長，但是通過藥物劑量的調整，品種的選擇，多重藥物的聯合使用，患兒能夠得到治癒。
小兒肌陣攣癲癇既往稱為良性肌陣攣癲癇，不一定需要藥物治療。大部分患兒預後良好，起病年齡集中在6個月到3歲，部分患兒有熱性驚厥病史或者家族史，臨床表現不是很嚴重，可能只是陣發性的短暫抽搐。患兒如果發作頻繁，一直未有效控制，可能導致精神運動發育 落後，可能有比較輕微的行為異常。
兒童癲癇持續狀態是兒科的嚴重性急症，癲癇持續狀態在癲癇患者中的發病率為1%-5%，病死率高達13%-20%。發作的時候儘量避免刺激患兒，避免按壓人中穴或者墊牙齒，異物塞到口腔容易造成患兒牙齒脫落，甚至堵塞氣道，造成更嚴重的後果。注意讓患兒平躺，如果 患兒有嘔吐，可以讓患兒側臥，清理一下口腔，避免嘔吐物堵塞氣道導致窒息。
兒童顳葉癲癇屬於癲癇中的特殊情況，顳葉在大腦分區裡屬於比較精細的部位，70%的癲癇患兒可以通過藥物治療獲得完全控制。但是，對於顳葉癲癇，尤其是伴有海馬硬化的顳葉內側癲癇，藥物治療效果不是很好，最好的治療方法是通過手術切除顳葉內側硬化的海馬，達到 控制目的。
小兒癲癇如果有明確的癲癇灶，比如局灶性皮層發育不良，抗癲癇藥物治療沒有效果或者效果不佳，頻繁發作影響患兒日常生活的時候，應該到專業的癲癇中心進行外科手術的評估。患者需要做詳細的頭顱影像學檢查，或者頭皮腦電圖，甚至顱內腦電圖，評估是否 有局灶性發作。如果明確有顱內侷限性病灶，適合手術治療，才能考慮手術治療。
生酮療法是20世紀美國最先發明的治療方法，目的是用來減肥，近些年用於癲癇認知治療。對於兒童難治性癲癇可以考慮試驗性運用生酮療法，生酮治療對於難治性癲癇，特別是對於嬰兒痙攣症，可以減少一半以上的發作頻率。