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甲溝炎的拔甲治療通常很快就可使引流通暢，炎症能夠較快好轉。通常3-5天炎症就有好轉，1-2周傷口基本上就能達到癒合，但是甲溝炎拔甲以後，並不能保證以後指甲的復發。甲溝炎的治療，除了預防之外，還需進行引流。由於甲溝組織比較緻密，發生炎症以後，很難得到較好的感染組織引流，所以使得炎症總是遷延不愈。拔甲治療以後，甲溝的炎症受到指甲的阻擋得到消除。所以炎症能夠快速引流出，如果配合傷口換藥和局部抗感染處理，可以在3-5天之內就使炎症得以控制。在1-2周之內，拔甲的傷口就可以癒合，炎症可以在早期處於較好的平穩狀態。
要使甲溝炎快速消腫，可使用抗生素藥膏，包括紅黴素藥膏、夫西地酸乳膏等，也可以使用可控制感染、消除炎症的魚石脂軟膏。甲溝炎是發生在甲溝的炎症，需針對炎症進行對症處理，但進行對因治療較為重要。紅黴素藥膏、夫西地酸乳膏可殺滅部分常 見的致病菌，患者合併有真菌感染引起的灰指甲時，可使用抗真菌藥物，如酮康唑乳膏，於甲溝處外用可產生抗真菌作用。
使腳趾甲產生軟化的藥膏較少，一般主要是使用消毒或控制感染的藥膏。腳趾甲周圍皮膚角質層質地較硬且較厚，溫水浸泡可使其變軟，同時配合抗生素和抗真菌藥物，可達到局部消腫的目的，也可產生部分軟化作用，但沒有特效藥能使趾甲完全軟化。
如果出現甲溝炎化膿，通常需要到醫院由醫生進行處理。甲溝炎會表現為甲溝旁邊的位置發白，而部分患者的甲溝稍微發黑，甚至整個甲溝到甲根均出現膿液。通常需要開放旁邊使膿液流出，儘量排淨後給予局部覆蓋、包紮，隔1天換藥2-3次，從而能夠好轉。如果指甲下和甲床間出 現大量積膿，則需考慮進行拔甲、掀甲，徹底清除膿液，目前由於甲溝炎導致拔甲的情況較為少見。
甲溝旁發生紅腫，通常表示炎症已經加重，需要正確處理炎症，比如局部消腫、消毒，同時進行抗感染治療。對於炎症增生反覆發作、長期不癒合的患者，可以採用甲溝成形術的方法進行治療。常見處理方法具體如下：
如果甲溝旁出現腫脹，通常提示存在炎症，需及時對甲溝進行消毒、消腫，同時做好後期預防甲溝炎復發的準備工作。甲溝炎的炎症主要表現為甲旁的紅、腫、熱、痛，有時觸摸時可出現疼痛，隨著炎症加重，可表現為組織出現腫脹，有時為紅腫，有時為 化膿的表現。比如甲下流膿或者流水，都提示甲溝炎症的變化或處在不同的階段，常見的處理措施具體如下：
魚石脂是治療甲溝炎較好的，且性價比較高的一類藥物，可以治療甲溝炎，並且通過使用魚石脂軟膏後，可以促進甲溝炎的炎症消散。魚石脂為治療炎症，包括皮膚軟組織炎症或手、足指端炎症的常見中成藥製劑，通過局部塗抹魚石脂軟膏後促使局部炎症聚集，在急性期感染髮作期間，控制炎症蔓延和進展，從而減輕炎症的症狀。
甲溝炎早期表現有甲溝的紅、腫、觸痛，並且有少量的分泌物。甲溝炎是甲溝一側的炎症，這類炎症往往由細菌性感染引起，細菌感染早期表現為皮膚紅、局部腫脹、有觸痛感，有時會感覺此處較硬。並且隨著炎症擴散，會出現腫脹和紅腫加重。有時會形成炎症，出現滲液、流水、流膿的情況，或者穿鞋時，發現鞋子上有炎症組織存在。
浸泡高錳酸鉀是治療腳趾甲溝炎的有效方法，甲溝炎多數是由甲溝的細菌感染引起的細菌性炎症，表現為甲溝的紅、腫、熱、痛以及流水、流膿。針對細菌性感染，可以選擇用高錳酸鉀浸泡的方式，因為高錳酸鉀是強氧化劑，對局部的傷口具有收斂、殺菌，使傷口保持相對無菌的作用。高錳酸鉀殺菌效果比較強，需要注意配置的濃度，高錳酸鉀有較強的氧化作用，對皮膚有燒灼作用，所以濃度不宜太高。
酒精浸泡腳趾可以對甲溝炎有治療作用，而且可以針對症狀產生殺菌、消腫和止痛效果。甲溝炎是甲溝的細菌性感染引起的炎症，可以出現紅、腫、熱、痛及甲下的積膿、流水、化膿樣的表現。治療甲溝炎可使用酒精，尤其是70%的醫用酒精，酒精是較好的皮膚黏膜殺菌劑，可以殺滅部分的皮膚黏膜細菌。同時酒精還具有揮發性，揮發性被應用在甲溝炎上面，可產生消腫作用，使局部的疼痛感減輕。