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傷寒最嚴重的併發症是腸穿孔，但通常發生率不高，大概在1%-4%，好發於病程的第2-3周，即患者傷寒病情緩解、體溫開始下降、症狀開始減輕時，容易出現腸穿孔，此時傷寒的病理改變為潰瘍期。腸穿孔的主要部位位於右下腹，是傷寒較常見的病變部位，即迴腸末段。
傷寒沙門菌感染導致的就是傷寒，這是一種細菌感染所導致的傳染病，主要是通過腸道傳染，所以也叫腸道傳染病。如果進食被細菌汙染食物或者飲用被汙染的水，有可能被傳染傷寒沙門菌感染，也就是傷寒。
確診傷寒最可靠的依據是病原學診斷，傷寒是由傷寒沙門氏菌感染引起的一種腸道疾病，所以無論血液、骨髓，還有糞便，只要能培養出傷寒沙門氏菌屬即可確診此疾病，故病原學檢出是確診金標準。對於一種疾病，不能單靠一個檢查確定，在疾病診斷過程中，需要根據臨床表現和輔助實驗室檢查進行最後綜合診斷。