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腎囊腫出血和感染灶機化以後，鈣質會沉積導致鈣化出現。如果出現腎囊腫伴鈣化，需警惕囊腫惡變可能，注意觀察囊腫形態、囊液是否渾濁、囊內是否有新生物等，另外還可以通過增強CT或增強核磁共振檢查輔助判斷。
腎囊腫由膨大的腎小管憩室構成，如果女性右腎囊腫<3個、大小<5cm、向外生長，對腎臟影響較小，不需要治療。如果囊腫比較大，單側腎囊腫>3個、大小>5cm、向內生長，可能影響腎臟正常形態和功能，腎組織的局部受到擠壓，出現感染、結石甚至出現腎功能受損。需要及時處理囊腫，可以選擇手術治療，具體方法如下：
腎囊腫如果出現囊壁鈣化，要明確囊腫的性質，因為囊腫可以分為單純性囊腫和相對複雜的囊腫，按照分級可分為四級。對於單純性囊腫出現囊壁鈣化，屬於較常見的現象，不需要特別擔心。複雜性囊腫可 能存在有囊性腎癌的風險，因此需要仔細進行鑑別診斷。如果只是單純性囊腫出現囊壁鈣化，往往是尿鹽沉積所致，不需要特殊關注。
單側的腎囊腫通常與先天性原因的關係較小，而且單側性腎囊腫對病人的影響也較小，所以右腎囊腫的主要注意事項是定期複查。如果單側腎囊腫數量比較多，則可能對腎臟造成一定影響，另外如果腎囊腫>5cm，也可能對腎臟的實質造成壓迫，導致病人損失一部分腎功能。
腎囊腫一般不會引起尿酸升高。腎囊腫由膨大的腎小管憩室組成，腎小管憩室在不斷長大的過程中，會逐漸變成腎囊腫。隨著腎囊腫囊液的分泌，腎囊腫會逐漸增大，到一定程度時，甚至會牽拉到腎臟包膜或者壓迫腎盂，導致病人出現腎區的疼痛，但是這與尿酸的代謝 和排出無關，所以腎囊腫不會導致尿酸升高。尿酸升高的原因，具體如下：