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臨床上孕酮在非孕期，主要由卵巢黃體分泌，少量由腎上腺產生，可促使子宮內膜從增殖期轉變為分泌期。正常孕育齡婦女在月經週期的不同時期抽血檢測孕酮，其正常值及意義不同，主要包括卵泡早期、晚卵泡期、黃體早期以及黃體晚期。沒懷孕孕酮值為0.2，一般指0.2μg/L，可能屬於孕酮低值。
女性發生黃體功能不全時，也有可能懷孕，因為患者還有排卵存在，卵子可與精子相遇形成受精卵，繼而種植到子宮腔裡。但黃體功能不全時，通常孕激素水平較低，此時可能不利於胚胎著床，或胚胎著床後不利於發育，即發生生化妊娠和胚胎停育。
黃體功能不全在臨床上是可以治癒的。主要表現為月經週期縮短，或者是在月經後半期時出現不規則的陰道出血，或者是懷孕以後導致自然流產，或者造成不孕不育，都與黃體功能不全有直接關係。
黃體囊腫屬生理性囊腫，常在體檢中發現，一般直徑小於3釐米，是機體的正常狀態，月經後會變小或消失。黃體囊腫有發生破裂的風險，也應高度重視。 說起黃體囊腫，首先要了解清楚什麼是黃體。成熟濾泡在排卵後，即形成黃體。在正常狀態上，黃體是直徑為2～3cm，為囊性黃體；當囊性黃體持續存在，囊腔內液體增多，直徑超過3cm以上者，就是卵巢黃體囊腫。黃體囊腫常見於育齡女性，黃體囊腫可能因為外力作用（如同房）發生破裂，會突然出現下腹疼痛、噁心嘔吐、大小便頻繁等，較嚴重的情況甚至會出現口乾、頭暈心悸、昏厥等。如果出現失血性休克表現，應予以手術治療。 月經失調，月經週期長的女性容易形成黃體囊腫，另外妊娠期卵巢會生理性增大形成黃體囊腫，但如果超聲發現雙側卵巢異常增大的黃體囊腫，要引起重視，要排除滋養細胞疾病的可能。隨著妊娠的結束，黃體囊腫也會隨之消失。 對於黃體囊腫，屬於生理性囊腫，一般無需特殊治療，觀察即可。
黃體功能不全性不孕，主要是在排卵過程中卵泡發育不太好所導致。並且由於後期的黃體功能不佳，分泌的雌孕激素比較低，不能滿足子宮內膜增生，所以轉化成分泌期的子宮內膜，導致胚胎著床受到影響，進而導致不孕、流產等情況。