橋本甲狀腺炎通常並不能自愈，橋本甲狀腺炎是自身免疫性甲狀腺炎裡面最常見的一種，是免疫系統不認識甲狀腺的某些成分，把甲狀腺球蛋白或甲狀腺微粒體認為是敵人產生了防禦反應，誤傷甲狀腺，造成甲狀腺增大，萎縮甲狀腺功能，逐漸的減退，出現甲狀腺合成分泌甲狀腺激素減少，最終出現甲減。
橋本甲狀腺炎通過甲狀腺自身抗體以及甲狀腺的超聲，進行臨床診斷，診斷以後需要定期複查。複查甲狀腺功能是否正常，如果甲功正常，不需要特別的治療。如果甲功異常需要甲狀腺激素替代治療甲減，可能進行相應的抗甲狀腺藥物的治療。但是橋本甲狀腺炎並不能自愈，可能長期的抗體增高，功能一直維持正常，需要定期複查。