噬血細胞綜合徵是一種遺傳或獲得性免疫調節異常導致的過度炎症反應綜合徵。原發性噬血細胞綜合徵是由於遺傳缺陷所導致的，具有明確的家族遺傳和(或)基因缺陷。繼發性噬血細胞綜合徵是由於自身免疫性疾病、持續性感染、惡性腫瘤或免疫抑制等多種原因造成的抗原刺激導致過度的免疫活化。
一、主要病因
1、原發性噬血細胞綜合徵：其是一種常染色體或性染色體隱性遺傳病，其發病基礎是由基因缺陷引起的NK細胞和細胞毒性T淋巴細胞功能減低或缺如所導致的過度免疫激活。發病機制可能是淋巴和單核因子持續產生，作為免疫應答的反應性T細胞分泌淋巴因子可活化巨噬細胞，尤其如γ-干擾素不僅能抑制造血，而且能活化巨噬細胞，而產生炎症因子所致。
2、繼發性噬血細胞綜合徵：其與各種潛在疾病有關，是由感染、腫瘤、風溼性疾病等多種病因啟動免疫系統的活化機制所引起的一種反應性疾病，通常無家族病史或已知的遺傳基因缺陷。感染相關噬血細胞綜合徵是繼發性噬血細胞綜合徵最常見的形式，包括病毒、細菌、真菌以及原蟲感染等，可以表現為感染觸發和(或)宿主免疫損害時的機會致病。惡性腫瘤相關噬血細胞綜合徵，可見於淋巴瘤、急性白血病、多發性骨髓瘤、骨髓增生異常綜合徵等。另外，妊娠、藥物、器官和造血幹細胞移植也可導致噬血細胞綜合徵。
二、誘發因素
繼發性噬血細胞綜合徵有多種誘發因素，主要包括以下幾個方面：
1、感染：感染是繼發性噬血細胞綜合徵最常見誘發因素，包括病毒感染、細菌感染、真菌感染以及原蟲感染等。其中病毒感染是最主要的誘因，尤其是EB病毒感染。
2、腫瘤：以淋巴瘤為主，另外其它一些腫瘤發展到晚期時也會誘發噬血細胞綜合徵。
3、自身免疫病：如系統性紅斑狼瘡(SLE)、成人Still病、風溼病等。最常見的是風溼病，風溼病雖然不會導致死亡，但有些風溼病顯得十分嚴重，原因就是有可能合併噬血細胞綜合徵，當合並這種疾病時，風溼病就是噬血細胞綜合徵的一個致病因素。
4、器官移植：特別是實體器官移植，例如肝移植、腎移植等，另外，造血幹細胞移植(即骨髓移植)後也可能引起噬血細胞綜合徵。
5、其他：代謝性疾病、藥物、妊娠都可能會誘發噬血細胞綜合徵。