細菌性痢疾的病變部位主要在乙狀結腸和直腸，嚴重的患者甚至可以累及到整個結腸和迴腸末端。主要致病菌是痢疾桿菌，它進入消化道以後，機體免疫能力下降，痢疾桿菌在腸黏膜上皮細胞和固有層中繁殖，導致腸道黏膜發生炎症反應、血管壞死。對應引起腹痛、腹瀉、粘液膿血便的臨床表現。細菌性痢疾是一種腸道傳染病，發現後需要立即治療，以免傳染給他人，喹諾酮類藥物，如環丙沙星可以用於治療。