高血壓是多囊腎患者常見的併發症，一般要求要使血壓控制在130/80mmHg。在腎功能正常的情況下，內生肌酐清除率在30mL/min以上，首選血管緊張素受體拮抗劑和轉換酶抑制劑控制血壓，如貝那普利，福辛普列，依那普利，氯沙坦，厄貝沙坦和纈沙坦等。還可以選用利尿劑呋塞米，托拉塞米，以及鈣離子拮抗劑苯磺酸氨氯地平片，非洛地平，倍他洛克等。