引起無痛血尿的原因主要包括泌尿系統的病變，來自於腎輸尿管、膀胱以及尿道的病變，均可以導致血尿的出現。對於老年人來說，無痛血尿應警惕泌尿生殖系統的腫瘤，尤其是尿路上皮癌，包括腎盂癌、輸尿管癌、膀胱癌，通常多以無痛性血尿為首發的症狀。
一些泌尿系統的畸形，如胡桃夾綜合徵也可以導致無痛性的血尿。全身的疾病，如血液病等也可以導致血尿的發生。老年人服用抗凝治療，也可能導致無痛性的肉眼血尿。運動後的血尿通常也沒有明顯疼痛症狀，伴有疼痛症狀多見於泌尿系統結石、泌尿系統感染等。因此在臨床上要針對無痛血尿進行病因的檢查，給予相應的治療。