狼瘡腎炎根據病理類型不同，治療方案也各不相同。I型和II型狼瘡性腎炎，病變相對較輕微，可僅應用糖皮質激素或羥氯喹等藥物進行治療。其餘病理類型多需要應用糖皮質激素聯合環磷酰胺或環孢素、他克莫司等免疫抑制劑治療，還可應用硫唑嘌呤、嗎替麥考酚酯、來氟米特、雷公藤等藥物。嚴重的狼瘡性腎炎合併腎功能不全時，需行血液濾過或血漿置換治療。