小兒紅斑狼瘡的確診依據，是根據患兒的症狀、病史、查體以及輔助檢查，綜合診斷。首先患兒要有多個系統、器官受累，比如有皮疹、口腔潰瘍，或者有關節炎，血液系統、腎臟損傷等。其次患兒要有特徵性的自身抗體，比如抗雙鏈DNA抗體陽性、抗sm抗體陽性、抗核抗體陽性、抗心磷脂抗體陽性。最後是一些影像學檢查，比如有心包積液等漿膜腔積液或者間質性肺炎改變。 只有綜合很多證據，才能診斷小兒紅斑狼瘡。