兒童系統性血管炎種類比較多，但治療藥物原則類似，大多數血管炎需要應用糖皮質激素以及免疫抑制劑治療。具體使用的劑量和選擇免疫抑制劑的種類，應根據患兒病情的嚴重程度和受累臟器決定。針對川崎病這種特殊的血管炎，一般可以使用免疫球蛋白和阿司匹林進行治療。另外患兒還需要應用鈣劑、活性維生素D以及質子泵抑制劑，預防激素的副作用。