系統性紅斑狼瘡患者需要查的指標較多，一般分為身體基礎性指標、免疫性指標以及併發症相關性指標三大類。身體基礎性指標主要是指血常規、尿常規、便常規、肝腎功能、血糖、血脂，檢查這些指標的目的在於明確患者的一般身體狀況，可初步查看系統性紅斑狼瘡是否造成了血液系統、泌尿系統、肝腎功能的損傷，同時也作為選擇治療藥物種類的參考。免疫性指標是診斷系統性紅斑狼瘡與判斷病情輕重程度的重要指標，如抗核抗體譜、自身抗體譜、免疫球蛋白水平、血清補體、狼瘡抗凝物、抗心磷脂抗體等。此外，免疫性指標也可以作為判斷疾病預後、轉歸及評價治療療效的參考標準。與併發症相關性的指標主要是評價系統性紅斑狼瘡所造成併發症的嚴重程度，如引起血液系統損傷，患者需要做骨髓穿刺檢查，如合併有腎臟損傷，需要做泌尿系B超、腎臟的CT等檢查。如合併有呼吸系統的損傷，患者需要做胸水B超、胸部CT、支氣管鏡等檢查。身體基礎性指標與免疫性指標是系統性紅斑狼瘡患者必須要查的指標，併發症相關的指標則應根據患者所出現的併發症不同而加以選擇。