兒童系統性紅斑狼瘡，至今發病原因以及發病機制尚不明確。一般認為是遺傳因素（近親有患此病者）、內在因素（比如小兒自身的免疫調節紊亂、機體激素水平失衡等）和外在因素（比如紫外線照射、服用某種藥物、機體受感染等）共同作用引起的，屬於自身免疫性疾病。系統新紅斑狼瘡可見於小兒的各個年齡期，甚至在新生兒也可以見到，但在青春期明顯增多。