非典的後遺症有，比如用了大劑量激素後會造成骨質疏鬆、糖代謝異常、血壓異常，最嚴重的可能有股骨頭壞死。肺部的表現有局部或者多發部位的肺纖維化，對病人的肺功能有一定的影響。當時對非典沒有有效的抗病毒藥物，是根據病人的症狀治療，比如咳嗽、咳痰、呼吸窘迫甚至白肺會用抗感染治療，甚至氣管插管、呼吸機輔助呼吸。