泌尿系感染主要以抗生素治療為主，泌尿系感染分為上尿路感染和下尿路感染。上尿路感染主要是腎盂腎炎，下尿路感染主要是急性細菌性膀胱炎和尿道炎。一般下尿路感染最常見，尤其是尿道炎，要根據感染的嚴重程度來選擇方案，如果全身症狀比較嚴重，如急性膀胱炎、腎盂腎炎，感染的症狀比較嚴重，血象也會升高。可以靜脈給予抗生素，比如頭孢類、喹諾酮類。
如果全身感染症狀比較輕，主要表現為局部的症狀，比如尿痛、尿道灼熱感、尿頻、尿急、尿道分泌物等症狀。可以給予口服抗生素治療，常用的像頭孢類、喹諾酮類、四環素類、阿奇黴素、磷黴素等，都可以很好的治療尿道炎的症狀。一般等臨床症狀完全消失，尿常規檢查白細胞完全轉陰，才認為是治癒，才能夠停藥，治癒後儘量消除誘發因素，減少感染的復發。