感染科屬於治療各種病原微生物導致疾病的科室，病原微生物包括病毒、細菌、支原體、衣原體、立克次體以及螺旋體、真菌、寄生蟲等。凡是這些病原微生物引起的疾病，都可以在感染疾病科來就診，其中部分是具有傳染性的疾病，但是也有部分是不具有傳染性的疾病，比如普通的肺炎、化膿性扁桃體炎、泌尿系統感染、敗血症等，這些病本身是不具有傳染性的，但是也歸為感染科來看。有些傳染性的疾病，比如呼吸道傳染病、新型冠狀病毒感染、流感、麻疹等，這些屬於有傳染性的，也需要在感染科來就診，包括病毒性肝炎這些。對於有些感染科，由於肝病看的比較多，所以所有的肝病、肝損傷可能都在感染科看，有些藥物性肝損傷、自身免疫性肝病，還有酒精肝，有些醫院這些肝病也都在感染科看。還有部分發熱待查的患者，不明原因的發熱、長期病因不清的發熱，也首先在感染科就診，進一步明確引起發熱的原因。