排除結石的方法通常分為兩大類，一類是藥物排石法，另一類是碎石法。藥物排石法就是藉助藥物的幫助來促進結石的排出，通常藥物能夠起到擴張輸尿管、消炎、促進輸尿管蠕動、利尿等等，通過這些方法來促進結石的排出。
碎石法就是利用體外碎石或者手術的方法，把大塊結石擊碎，變成小塊結石而更容易排出。不管用哪種方法，都是要配合患者多運動以及大量喝水。結石排出與結石的大小、結石的位置、結石停留的時間關係非常密切，所以不論哪一種方法成功率都不是100%，包括手術，很多比較大的結石，一次手術也是很難清理乾淨的。