得了結石在臨床上通常會有疼痛、血尿，或者合併感染的症狀，在臨床上對於活動的結石，有可能會出現臨床症狀。對於較小的靜止性結石，通常可能沒有任何臨床症狀，在體檢時偶然發現，而結石從腎臟掉入輸尿管，可以引起突發的腎區的疼痛，疼痛性質為絞痛，可以向腹部、下腹部、會陰區、陰囊等部位進行放射。同時可以伴隨有血尿，如鏡下血尿或者肉眼血尿合併感染，可以出現尿頻、尿急、尿痛等臨床症狀。結石活動時可以伴隨噁心、嘔吐，雙側結石梗阻甚至可以引起少尿等臨床表現。
膀胱結石通常可以引起血尿，甚至尿瀦留，排尿的中段尿道結石可以引起突發的尿瀦留，以及間斷排尿、排尿變細等，可以通過相應的影像學來進行明確。