慢性結腸炎的常見臨床症狀主要包括有腹痛，腹脹，腹瀉，便秘，甚至部分患者可以出現腹瀉與便秘交替的情況，以及大便的改變（大便次數的增加，大便次數減少，大便性質為粘液便，血便等異常）其中腹痛症狀較為典型，尤其是下腹部疼痛，呈現為墜疼，隱痛，尤其是進食刺激食物以後或是受涼，勞累，菸酒刺激等情況下引起以上症狀加重。