慢性結腸炎的主要症狀是腹部疼痛，伴有腹瀉，腹部疼痛以臍周部為主，陣發性發作。一般在排便後腹部疼痛能夠改善，腹瀉呈稀糊狀大便，有時會出現大便帶有粘液或者膿血，腸鏡檢查可以提示粘膜有淺潰瘍或者糜爛形成。針對慢性結腸炎的治療，症狀較輕時，可以口服腸道益生菌，比如乳酸菌素顆粒、雙歧桿菌三聯活菌膠囊等等，口服馬來酸曲美布汀可以調節胃腸蠕動。如果出血糜爛比較嚴重，診斷為潰瘍性結腸炎時，需要口服美沙拉嗪治療。