肝膿腫主要是包括系統性的肝膿腫和阿米巴性肝膿腫，兩者均有不同的特點。細菌性肝膿腫主要是繼發於膽道感染和其它化膿性的疾病，病情急驟嚴重，全身中毒症狀明顯，可以出現明顯的寒戰，高熱，體溫可以達到39-40度。膿液多為黃白色的膿液，培養可以發現細菌，膿腫較小，常為多發性。而阿米巴性肝膿腫，主要是繼發於阿米巴痢疾，多見於西部牧區患者，起病較為緩慢，病程比較長，可以出現不規則的發熱以及盜汗，膿液大多為棕褐色，沒有臭味，膿腫較大，多為單發，多見於肝臟的右葉。如果囊腫破裂容易造成過敏性休克。