膽管結石分為肝內膽管結石和肝外膽管結石。肝內膽管結石侷限在某一肝段或肝葉，會引起肝組織萎縮、纖維化，甚至膽管的癌變，還是建議手術治療。可以行膽管切開取石或是肝部分切除治療。肝外膽管結石有兩種方法，一種是ERCP內鏡下十二指腸乳頭切開或是球囊擴張取石,另一種就是手術治療，手術分為開腹手術和腹腔鏡手術，如果身體基礎條件可以的話還是建議腹腔鏡手術，如果身體條件差，可以選擇ERCP取石。但對於肝內膽管的小結石，沒有症狀且沒有引起肝組織病理學變化，可以隨訪。