膽管結石，就是指發生在膽管中的結石。膽管結石包括肝內膽管結石和膽總管結石。一般來說，肝內膽管結石都是原發性的，主要與膽道感染，以及膽道梗阻引起有關，其成分主要是膽色素性結石；而膽總管結石可以肝內膽管排入到膽總管中，或者是膽囊結石，經膽囊管排出到膽總管中，還有極少數如先天性膽總管囊腫患者，因為膽總管膽汁排出不暢導致膽泥沉積發生。所以它的成分可以是膽固醇性的結石，或者是膽色素性結石。