膽管結石的嚴重程度根據結石的分佈、數量以及有無症狀等等決定。對於關鍵通道部位的結石像膽總管、肝門部和左右肝管的結石，是很容易導致膽管阻塞，誘發急性膽管炎，嚴重時可導致重症膽管炎，該種類型可導致嚴重病情，應該積極處理；對於肝內多發的結石，導致肝臟形態萎縮，經常導致上腹隱痛、悶脹不適的，該種類型可誘發膽管炎，長久可導致癌變，也應該選擇手術治療；而對於肝內散發少量的結石，甚至與肝化灶的鑑別不清，該種類型無需特殊治療只需定期體檢覆查。