大部分腦血栓可以治癒，如果是輕型的腦血栓患者，可能只有輕度的肢體偏癱、偏身麻木或言語障礙，經過急性期的用藥治療及康復期，大約2-4周的治療基本能恢復正常。
如果是中等程度的腦血栓，比如肢體的肌力在三級左右，並且有語言障礙，甚至出現頭暈、飲水嗆咳等，經過急性期的積極治療，在康復期兩個月左右基本上能恢復正常。如果是比較嚴重的腦血栓，堵塞的是腦部大血管，造成非常嚴重的神經功能障礙，比如肢體完全不能活動、完全不能說話，以及不能吞嚥，甚至意識障礙等，這樣的患者治療雖然經過急性期和康復期之後，仍然有可能遺留一定程度的後遺症，或在急性期之內死亡。