潰瘍性結腸炎在急性發作期應臥床休息，及時糾正水與電解質平衡紊亂，並給予容易消化的流食，病情好轉之後改為營養豐富的少渣食物，對於重症以及爆發型病人，應住院觀察，密切觀察病情變化，必要時輸注蛋白。水楊酸製劑主要是硫氮磺吡啶，作為首選的藥物，主要用於輕型中型病人，或者是危中爆發型病人用糖皮質激素。硫唑嘌呤適用於反覆發作的潰瘍性結腸炎以及激素治療無效者。如果有併發症，必須要手術治療。