慢性膀胱炎的治療非常困難，但也不是沒有治癒的可能性。慢性膀胱炎的原因，首先，由於急性膀胱炎轉化而來，急性膀胱炎治療不徹底或者不規範而遷延不愈，形成了慢性膀胱炎。其次，由於具有泌尿系感染的好發因素，比如嚴重的糖尿病應用激素或免疫抑制劑，尿路有梗阻，留置導尿管、支架管等等，這些都是容易發生泌尿系感染的因素。有這些好發因素存在，就容易反覆發作炎症，使細菌耐藥，而逐漸變成慢性膀胱炎。
慢性膀胱炎的治療，首先，要進行細菌培養，查一查是哪一種細菌感染，有針對性的根據藥物敏感性測試來選擇抗生素，抗生素的使用要注意劑量足夠、療程足夠，並且邊治療邊複查，看看治療效果，直到徹底治癒。其次，要注意生活中的配合和調理，要增加飲水量，少吃辛辣、刺激的食物。然後，積極治療原發病和容易導致泌尿系感染的好發因素，去除這些因素，會對慢性膀胱炎的治療起到積極的作用。