腎結石急性發作時為腎絞痛，主要的治療方法為藥物鎮痛、解痙，腎絞痛急性發作期適當限制水的入量和利尿劑的應用，這二者可以加重腎絞痛的發作。腎絞痛鎮痛藥物的使用，遵循三級鎮痛原則：一級鎮痛藥為非甾體類鎮痛消炎藥物，常用藥物有雙氯芬酸鈉、布洛芬和吲哚美辛栓，雙氯芬酸鈉能夠減輕輸尿管水腫，明顯減少腎絞痛的反覆發作；二級藥物為非嗎啡類中樞鎮痛藥，常用藥物為曲馬多，該藥無呼吸抑制作用、無便秘，耐受性和依賴性很低；三級鎮痛藥物為較強的阿片類受體激動劑，具有較強的鎮痛和鎮靜作用，常用藥物有強痛定和杜冷丁。
其它可配合以解痙藥物包括M受體阻滯劑，常用藥物有阿托品和山莨菪鹼，可以鬆弛輸尿管平滑肌，緩解痙攣。黃體酮可以抑制平滑肌的收縮而抑制痙攣，對止痛和排石有一定療效。鈣離子拮抗劑對緩解腎絞痛也有一定作用，α1受體阻滯劑能夠緩解輸尿管平滑肌痙攣，治療腎絞痛有一定效果。此外，針灸也有一定解痙、止痛效果。如經藥物治療不緩解，可以急診行輸尿管引流或急診體外碎石，輸尿管鏡手術取石等處理。