拉水樣便往往提示腸道蠕動過快，水分沒有被腸道所吸收所導致，如果是短期出現有可能以感染為主，無論是細菌感染還是病毒感染，如果急性發作嚴重時都可能會拉水樣便，食物不耐受，比如特殊人群進食了特殊的食物導致胃腸道過敏，也可以出現類似的症狀。
如果水樣便持續了一段時間，考慮是慢性的，應考慮是不是有小腸病變，如蛋白丟失性腸病，一些特殊的小腸疾病都可能導致腹瀉並且拉水樣便。甲狀腺功能亢進導致內分泌失調，也可以出現類似症狀。所以根據疾病的急、慢性以及相應症狀，病因是不同的。如果是短期出現，注意飲食能自愈，如果是慢性的過程一定要及時就診，明確診斷。