基因檢測對於肺鱗癌的臨床參考價值並不大。這是因為肺鱗狀細胞癌的患者，EGFR、ALK等基因檢測的陽性率非常低，而且即使基因檢測陽性的患者，應用靶向藥物治療後其臨床有效率也並不高。靶向藥物治療的有效率要低於全身化療的有效率，因此對於晚期肺鱗癌的患者，無論是我國的肺癌診治指南，還是美國的nccn指南，均不建議做基因檢測。