肛周囊腫臨床上是指肛周膿腫。肛周膿腫的最佳治療時間，提倡早期治療，就是肛周膿腫開始發作時就治療，比如靜脈輸注抗生素類藥物，如替硝唑注射液等。因為，肛周膿腫的病情發展比較快，一旦膿腫形成，就需要手術治療。早期開始治療，有可能將炎症控制在初發狀態，在膿腫還沒有形成時，就把病原菌消滅，避免膿腫的形成，有可能避免手術之痛。