膈上食管憩室主要表現從輕度消化不良至明顯吞嚥困難或反流，其他常見症狀可有胸骨下以及上腹不適、疼痛，部分患者可表現咳嗽、呼吸困難、口臭、味覺異常等症狀。本病治療不及時可合併出現食管運動功能紊亂、瀰漫性食管痙攣、賁門失弛緩症。
一、典型症狀
1、胸痛、燒心、反酸：憩室內出現食物滯留會導致胃食管反流及嘔吐的症狀出現，但是胸痛主要集中在胸骨口，是由於食管痙攣導致。
2、吞嚥困難：是膈上食管憩室最主要的症狀，症狀會呈現進行性加重，初期僅有進食時輕微不適。但是如果是長期的吞嚥困難極容易造成營養不良、消瘦等表現。
二、其他症狀
1、咳嗽及呼吸困難：憩室膨出會壓迫氣管，如果食管反流也會引發呼吸道症狀。
2、Boyce徵：憩室較大者會聞及胸內有“咕咕”聲，這是因為吞嚥的時候空氣、食物與分泌物在憩室內的混合導致。
3、口臭、味覺異常：由於憩室內食物瀦留並且腐敗引起。