先天性腸旋轉不良的手術名稱為切斷壓迫十二指腸的腹膜索帶，遊離粘連的十二指腸或鬆解盲腸、腸扭轉復位術或壞死腸管切除吻合術。以上手術，除了寶寶的腸管出現廣泛壞死或伴有其他畸形的情況外，一般預後都良好。先天性腸旋轉不良最易發生先天性腸梗阻，大多數寶寶一般無任何症狀。當寶寶出現腹痛、噁心、嘔吐、腹脹、不排便等症狀時，需進行腹部拍片，B超、CT等檢查後才被發現，應該及時進行手術治療。