甲狀腺囊腫由甲狀腺結節囊性變而來，其內為淺黃色透明的囊液，一般很安全，但有少數可以發生囊內出血，還有更少見的囊內感染。
前者因為囊腫壁的血管破裂出血而致，多有誘因，如咳嗽等震動或者擠壓，表現為迅速增大，伴有疼痛，甚至發低燒。後者表現為囊腫增大較平時快，且多伴發燒，觸之會痛，常伴頸側區淋巴結腫大及疼痛。