自然流產後幾天能流乾淨，需要根據每個患者的具體情況，進行嚴密觀察後才能瞭解。因為自然流產有一個過程，不同狀態、不同流產類型而導致流血的時間有所不同。如果是早期先兆流產，可能流血時間比較短。出現完全流產之後，即在完全排出胚胎後，可能3-5天也就流完。
而如果還殘留有胎盤或者胚胎組織，出血就會很多，甚至需要做手術才可以，在手術之後一週左右完全流完，達到胎停育狀態，需要用藥物或者流產的方式將宮內停育的胚胎組織排到體外。所以，各種不同形式、狀態，流完的時間長短也有所不同，需要進行具體分析和估計。