蛋白S活性低於正常值就可能會導致胎停育的發生，蛋白S和蛋白C都是維生素K依賴的抗凝血酶，主要是在凝血調節過程中起重要作用，起到拮抗凝血酶的作用。
如果蛋白S活性下降，就可能會導致體內凝血酶的活性增加，會導致血栓的發生，會導致流產、早產、胎兒宮內生長受限等一系列產科併發症的發生。蛋白S的活性，不同的實驗室有不同的檢測標準，如果低於正常值，同時伴有習慣性流產的發生，就可以診斷蛋白S缺乏，治療上主要以低分子肝素為主的抗凝治療。