新生兒肺部感染的治療，根據感染病原體的不同，是否有合併症等治療時間也不一樣。一般的新生兒肺部感染血培養陰性，治療時間大概在7到10天。如果血培養陽性，診斷為敗血症，那需要除外有沒有化膿性腦膜炎，治療時間就相對延長。敗血症至少要療程兩週，複查血培養轉陰，才能停止治療，如果是化膿性腦膜炎，必須複查腦脊液正常兩次，才能停止藥物治療。